空氣過濾器運用需合理確定各級過濾器的效率：
一般情況下，最末一級的空氣過濾器決定空氣凈化的程度，上游的各級過濾器只起保護作用，它保護下風端過濾器以延長其使用壽命，或保護空調系統以確保其正常工作。
空調設計中，首先應根據用戶的潔凈要求確定最末一級空氣過濾器的過濾效率，然后，選擇起保護作用的空氣過濾器。如果這級過濾器亦需要保護，再在它的上風端增設過濾器。起保護作用的過濾器統稱為“預過濾器”。
空氣過濾器的使用過程中應妥善匹配各級過濾器的效率。若相鄰兩級過濾器的效率規格相差太大，則前一級起不到保護后一級的作用;若兩級相差不大，那么后一級的負擔又會太小。
潔凈室末端高效過濾器的使用壽命應為5~15年，影響使用壽命的最主要因素是預過濾器的優劣。
當使用G→F→H→U效率規格分類時，可方便的估計出所需各級過濾器的效率。在G2-H12中，每隔2-4擋設置一級過濾器。例如：G4→F7→H10，其中，末端H10(亞高效)過濾器決定送風的潔凈水平，F7保護H10，G4保護F7。
潔凈室末端高效過濾器前要有效率規格不低于F8的過濾器來保護;超高效過濾器前可選用F9-H11的過濾器。中央空調本身應有效率規格不低于F5的過濾器來保護。
在無風沙、低污染地區，F7過濾器前可不設預過濾器;在城市的中央空調系統中，G3-F6是常見的初級過濾器。
究竟應設什么效率級別的預過濾器來保護后一級的過濾器，這需要設計師和現場工程師將使用環境、備件費用、運行能耗、維護費用等因素綜合考慮后決定。
實例：
某100級潔凈室，設置了F5→F8→H10→H13四級過濾，末端H13高效空氣過濾器用了8年。
某潔凈室高效過濾器前只有F5過濾器保護，用戶每年都要更換高效過濾器。
重度污染城市的某新風凈化系統中過濾器設置為G3-H10，系統運行半個月后H10過濾器報廢。
某汽車噴漆流水線，空氣過濾器設置為G3→F6→F5。其中，末端F5為屋頂滿布的過濾材料，它僅起工藝要求的均流作用;F6決定了送風的凈化水平。
總而言之，在空氣過濾器系統中，末級空氣過濾器性能要可靠;預過濾器的效率規格要合理;初級過濾器的維護要方便。
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