高效過濾器是清除空氣微生物的最有效手段：
所有空氣微生物都是顆粒物，高效過濾器不分死活對顆粒物一概通吃。只要過濾器上不含營養物，使用環境不過于潮濕，微生物失去了生存的條件，也就死掉了，不死也無法繁衍了。從實際效果看，過濾器是清除空氣微生物的最有效手段。但過濾器太普通了，普通得讓人懶得去想它。
特別應該注意的是醫藥和食品行業用的高效過濾器。國產傳統有隔板高效過濾器中含紙隔板和木制外框，過濾材料為親水型玻璃纖維濾紙。其中，紙和木材是營養物，濾紙吸收的水分有利于微生物繁衍。淘汰木框紙隔板過濾器、淘汰親水型高效濾紙，這是個老議題，可它是減少微生物污染風險的最簡單、最直接手段。
凈化行業普遍認為，空氣中不存在孤立的細菌和病毒，它們或附著在其他顆粒物上，或自己聚成一團。過濾器最難過濾顆粒物的尺寸為 0.1 μm ~0.3 μm，細菌本身比這個尺寸大得多，粘有細菌的顆粒物更大，因此很容易被過濾掉。絕大多數病毒小于 0.1 μm，但病毒附著的顆粒物大，所以也容易過濾。胞子可能單獨存在，胞子的尺寸與細菌相當，屬于大顆粒物，因此也比較容易過濾。總體上講，過濾器的效率高了，空氣微生物就少了。
各種抗菌手段都可用于高效過濾器，例如光催化、常溫催化、溶菌酶、駐極體、抗菌劑。只要價格合理、沒有明顯副作用。
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